騰訊醫(yī)療AI實驗室和美國加州大學(xué)聯(lián)合發(fā)布最新研究
2018-11-15 16:57:05AI云資訊991
騰訊醫(yī)療AI實驗室和美國加州大學(xué)合作,正在探索人工智能(AI)如何幫助分割過程,輔助放療規(guī)劃。 近日聯(lián)合在國際權(quán)威期刊《Medical Physics》發(fā)表最新研究成果——《器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò):深度學(xué)習(xí)用于快速和全自動整體頭頸危及器官靶區(qū)勾畫》(AnatomyNet: Deep Learning for Fast and Fully Automated Whole-volume Segmentation of Head and Neck Anatomy)。
在頭頸癌放療過程中,醫(yī)生根據(jù)患者CT圖像手動描繪放療靶區(qū)和危及器官(Organ at Risk,OaR),目的是最大限度將放射劑量集中在靶區(qū)內(nèi),而讓周圍正常組織或器官少受或免受不必要的傷害。然而,勾勒過程非常耗時,降低診療效率的同時,更是耽誤了患者的治療時間。該研究提出一種深度學(xué)習(xí)模型——“器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(AnatomyNet)”,可以快速地對整張CT的所有切片進行全自動化器官分割(Segmentation),在小于1秒鐘的時間內(nèi)完成一整幅頭頸CT的危及器官勾畫,大幅度提升了放療靶區(qū)勾畫效率。研究成果一經(jīng)發(fā)表,就引起國際領(lǐng)域內(nèi)廣泛認(rèn)可,目前已被引用多次。與合作醫(yī)院的臨床測試表明,AI靶區(qū)勾畫能夠大幅度減少醫(yī)生工作時間,同時提升勾畫準(zhǔn)確率。
研究成果獲國內(nèi)外肯定
《Medical Physics》是美國醫(yī)學(xué)物理學(xué)家學(xué)會(The American Association of Physicists in Medicine,AAPM)的官方期刊,該研究成果在期刊上發(fā)表后,目前已經(jīng)被多個機構(gòu)引用。
美國德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心(MD Anderson Cancer Center)對騰訊醫(yī)療AI實驗室的“器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)”表示關(guān)注,并把該研究成果作為中心一項大規(guī)模研究的重要部分。該中心在美國乃至全球皆享譽盛名,多次被評為美國最佳癌癥研究機構(gòu),也是公認(rèn)的全球最好的腫瘤醫(yī)院。
此外,論文一經(jīng)發(fā)布,很快被加拿大瑞爾森大學(xué)、中國中科院等多家機構(gòu)學(xué)者在其研究報告中被提及和引用,作為最新的研究突破獲得國內(nèi)外認(rèn)可。
“器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)”為何廣受關(guān)注?
在放射治療過程中,醫(yī)生需要基于患者CT圖像勾畫出危及器官,而一個標(biāo)準(zhǔn)的CT圖像包含上百張切片,醫(yī)生需要單獨在每個切面中勾畫出危及器官的位置,手動描繪非常耗時。一般來說,根據(jù)醫(yī)生熟練程度,大概需要幾個小時的時間。
自動危及器官分割技術(shù)可以同時減少治療計劃所占用的時間,以及提高治療計劃的質(zhì)量?,F(xiàn)有的器官自動分割主要使用基于模板的技術(shù)。這類技術(shù)盡管需要復(fù)雜的技術(shù)來創(chuàng)建模板,但是不能夠充分地對病人之間的差異進行建模。需要時間超過20分鐘。
騰訊醫(yī)療AI實驗室研究團隊提出器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(AnatomyNet)深度學(xué)習(xí)方法,可以對頭頸CT圖像進行危及器官分割。器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入是頭頸CT圖像的所有切片。該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以一次性產(chǎn)生所有危及器官的預(yù)測結(jié)果。
器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建是基于常用的三維U網(wǎng)絡(luò)(U-net)架構(gòu),但是騰訊AI實驗室在三個重要的方面對其進行了擴展:1)一種新的在整幅CT圖像上進行自動分割的編碼方式,而不是在局部圖像塊上,或者一部分CT圖像切片上分割;2)在編碼層中,加入三維Squeeze-and-Excitation殘差結(jié)構(gòu)來進行更好的特征表示學(xué)習(xí);3)一種新的結(jié)合Dice損失和Focal損失的損失函數(shù),用來更好地訓(xùn)練該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。在深度學(xué)習(xí)的器官分割中,使用這些技巧解決兩個主要的挑戰(zhàn):a)小器官的分割(比如,視神經(jīng)和視交叉)。這些小器官僅僅只有幾個切片。b)對于一些器官結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)標(biāo)注不一致以及標(biāo)注缺失給訓(xùn)練造成一些問題。
圖1:器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)危及器官分割結(jié)果
圖1為器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)危及器官分割結(jié)果,其中綠色為醫(yī)生標(biāo)注,紅色為器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測結(jié)果,黃色表示標(biāo)注和預(yù)測重合,結(jié)果顯示高度一致。
從圖2的動態(tài)效果圖上,可以更清晰地在三維CT所有切片上看到器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測和醫(yī)生標(biāo)注的比較,其中左邊顯示的是醫(yī)生標(biāo)注,右邊顯示的是器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測結(jié)果。
圖2:動態(tài)效果圖
從結(jié)果上說:和之前MICCAI競賽中最好的方法相比,器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)平均提升了3.3%的Dice指標(biāo)。器官神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)僅僅使用0.12秒就可以完全完成一整幅CT圖像(178?512?512)的分割。該速度極大地縮短了之前方法所用的時間(20分鐘以上)。除此之外,該模型可以處理一整幅包含所有切片的CT圖像,以及一次性勾畫所有的危及器官,不需要很復(fù)雜的預(yù)處理以及后處理。
騰訊醫(yī)療AI實驗室開發(fā)的深度學(xué)習(xí)模型提供了一種CT圖像勾畫危及器官的可行思路。表明深度學(xué)習(xí)可以提升器官分割準(zhǔn)確率,簡化自動分割器官的流程。該技術(shù)可以在小于1秒鐘的時間內(nèi)完成一整幅頭頸CT的危及器官勾畫。
騰訊醫(yī)療AI實驗室以科研成果推動技術(shù)創(chuàng)新
除本次發(fā)表于《Medical Physics》的研究成果,今年7月,騰訊醫(yī)療AI實驗室已有3篇論文分別被KDD 2018、SIGIR 2018、COLING 2018三個國際頂尖學(xué)術(shù)會議收錄,論文的主要研究方向為醫(yī)療知識圖譜中實體關(guān)系的發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用。
騰訊醫(yī)療AI實驗室是騰訊專為醫(yī)療領(lǐng)域打造的人工智能實驗室,目前在硅谷、北京、深圳設(shè)立了三個分支。其作為騰訊醫(yī)療健康領(lǐng)域眾重要技術(shù)驅(qū)動,騰訊AI實驗室在學(xué)術(shù)研究層面不斷發(fā)力,致力于AI醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的前沿突破。
實驗室的主要研究方向是基于自然語言理解、醫(yī)學(xué)知識圖譜、深度學(xué)習(xí)、醫(yī)療影像、貝葉斯網(wǎng)絡(luò)、多模態(tài)分析等基礎(chǔ)技術(shù)構(gòu)建醫(yī)學(xué)知識引擎、醫(yī)療推理引擎、臨床輔助診斷引擎、問診對話引擎等智能平臺。
騰訊醫(yī)療AI實驗室致力于推動醫(yī)療AI開創(chuàng)性技術(shù)研發(fā),目前,騰訊醫(yī)療AI實驗室已推出帕金森病運動功能智能評估系統(tǒng),其他主要產(chǎn)品還包括臨床輔助決策支持系統(tǒng),面向腦卒中、急性冠脈綜合癥等高危易誤診疾病提供臨床輔助決策支持,以及心電圖智能分析軟件,利用AI技術(shù)實現(xiàn)心電圖監(jiān)測結(jié)果的自動判讀和預(yù)警等。
近日,以騰訊醫(yī)療AI實驗室為技術(shù)核心主體,騰訊作為牽頭單位承擔(dān)“2018年科技部重點研發(fā)計劃數(shù)字診療裝備專項基于人工智能的輔診系統(tǒng)項目”,將會組建高精尖隊伍承擔(dān)國家科研重任,搭建AI輔診平臺并向臨床應(yīng)用推進。
未來,騰訊醫(yī)療AI實驗室也將持續(xù)通過研發(fā)AI技術(shù)與醫(yī)療的深度結(jié)合,構(gòu)建良好的技術(shù)生態(tài),從臨床角度解決問題,服務(wù)于醫(yī)患雙方,助力醫(yī)療行業(yè)智慧化升級,同時著重助力分級診療國策的落地。
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